Momomiya Ichigo, 13 éves (bár cseppet idősebbnek néz ki^^) átlagos japán lány. Iskolába jár, s mint minden lány az iskolában, szerelmes a suli legtutibb srácába, Aoyamába. Sikerül is randit összehozni vele, elmennek egy állat kiállításra. Ám a kiállítás macska szimbóluma egy kamerát rejt magában, ami mögül két különös férfinak Ichigo felkelti a figyelmét. A múzeum utáni sétán Aoyama egyedül hagyja a lányt, aki észrevett egy cuki rózsaszínű boltot, ám a bolt tetején is ugyanaz a macskaszimbólum található, mint a múzeumban. S a két férfi Ichigo DNS-ét vizsgálva beindítja a Mew Project-et. Földrengés tör ki és Ichigot fénysugarak ölelik át, megjelenik egy Iriomote macska, ami eggyé válik Ichigoval. A külvilág számára Ichigo csak elaludt. Azonban az eset után különleges képességekkel gyarapszik a lány repertoálja. Magas helyekről talpra esik, és megőrül a halakért, és nyávogni kezd (mint egy cica, nem furcsa?^^) Később egy parkban egy szörny megtámadja Aoyamát, s megjelenik az egyik különös férfi, s odaad Ichigonak egy bilétát, mely segítségével átváltozik Mew Mew Strawberryvé (Mew Ichigo).

Miután legyőzi, kiderül, hogy a szörnyeteg Chimera Animal, egyike az olyan Alieneknek, akik megszállva a földi állatokat szörnyekké változtatják őket. Az egyetlen védekezési forma ellenük és a közelgő krízis ellen a "Különleges állatok", akik képesek fajtájukat megvédeni. A két férfi ezért keres olyan embereket, akik képesek befogadni a különleges állatokat magukba, hogy felvehessék a harcot az Alienek ellen. 4 társa van akiket megkell találjon, hogy segítsenek neki a küldetésben. Mindegyikükön megjelenik egy-egy különös jel. Mint, Lettuce, Zakuro és Puding, mindegyikük egy-egy állatot képviselve harcol a Földért. Valamint mindegyikük a két tudós férfi titkos főhadiszállásán fog dolgozni... a cuki rózsaszín épületben, ami a Cafe Mew Mew sütiző, kávézó.^^ Feltűnnek majd idegenek, akik irányítják a Chimera Animalokat, valamint egy titokzatos Kék lovag, aki mindenáron meg akarja óvni Ichigót, s kiderül, több van a háttérben, mint az, hogy kutyák és egerek változnak szörnyeteggé.